В письме от 13.01.2022 № 03-04-06/991 ведомство отметило, что вакцинирование персонала является частью мер, призванных обеспечить безопасность условий труда. Иначе говоря, вакцинация проводится не в интересах сотрудников и не приводит к их выгоде. Следовательно, затраты на вакцинацию не облагаются НДФЛ.
Что касается налога на прибыль, по пп. 7 п. 1 ст. 264 НК РФ затраты на вакцинацию относятся к прочим расходам. По пп. 49 п.1 ст. 264 НК РФ такие затраты можно учесть в расходах только при их обоснованности и документальном подтверждении.