В письме от 08.02.2022 № ЗГ-3-15/998@ налоговая служба сообщила, что под прослеживаемость подпадают товары из списка, приведённого в постановлении правительства от 01.07.2021 № 1110. Также прослеживаемость применяется, если выполняется одно из условий, указанных в п. 3 Положения о национальной системе прослеживаемости.
В этом пункте не указано условие о ввозе товаров в РФ и помещение под таможенную процедуру свободной таможенной зоны.
Таким образом, если товар ввезли в Россию и поместили под таможенную процедуру свободной таможенной зоны, то он не является прослеживаемым.