Данная функция в программе находится в разделе "Настройка" - "Реквизиты организации" - "Учетная политика и другие настройки" - "НДФЛ".
Включается она автоматически, в момент, когда доход сотрудника превышает 5 млн. рублей.
В документе "Начисление зарплаты и взносов" на закладке "НДФЛ" в отдельной колонке будет выделен "Налог с превышения", рассчитанный с суммы превышения дохода по ставке 15 процентов.