Об этом налоговая пояснила в письме от 28.12.2022 № СД-3-8/15024@.
Ведомство напомнило, что, в соответствии с п. 7 ст. 78 НК, заявление о зачете или о возврате суммы излишне уплаченного налога можно подать в течение 3 лет со дня уплаты этой суммы, если иного не предусматривает российское налоговое законодательство.
С учетом того, что налоговое законодательство не предусматривает возврата (зачета) суммы, образованной за пределами срока, установленного п. 7 ст. 78 НК, то и при формировании сальдо единого налогового счета из состава совокупной суммы обязанностей такие суммы переплаты исключаются.
Соответственно, если переплате более 3 лет, на едином налоговом счете она учитываться не будет, и зачета таких сумм производиться не будет.