Компания представила декларацию по НДС, а через некоторое время отправила уточнёнку, в которой заявила о вычете. Налоговая проверила уточнёнку, сняла вычеты и составила об этом акт. Решения по проверке ещё не было, поэтому компания подала вторую уточнённую декларацию. Контролёры не стали её проверять и вынесли решение о доначислении и штрафе за неуплату налога.
В суде компания отметила, что вторую уточнёнку подала до составления решения о проверке, а значит, ИФНС должна была проводить проверку на основании этого документа.
Суд отметил, что моментом окончания камеральной проверки считается истечение 3 месяцев по п. 2 ст. 88 НК РФ. Если проверка завершается раньше этого срока, то датой её окончания считается та, что указана в акте камеральной проверки.
В постановлении от 05.10.22 № А66-10775/2021 Арбитражный суд Северо-Западного округа напомнил, что вторую уточнённую декларацию компания подала после того как составили акт проверки первой уточнёнки. По п. 9.1. ст. 88 НК РФ с завершением камеральной проверки прекращаются все действия инспекции по отношению к ранее поданным декларациям. Значит, налоговая правомерно не приняла вторую уточнёнку.